人が自身の意思をもって操作する、特殊な力をもつからくり人形「案山子」の存在に囚われた僻地の村・空守村。その閉鎖的な村を出て東京で平穏な生活を送る大学生・枸雅匡平は、ある日機を見計らって想いを寄せる同学部の史馬日々乃と二人きりになるが、その時エレベーターにて惨殺された死体を発見してしまう。一方、空守村では、とある事情から幽閉されていた匡平の幼馴染・枸雅阿幾が彼の出奔を知り脱走し、東京へ向かっていた。そして匡平の妹・詩緒も、阿幾を追うため上京してくる。混迷極まる人々の運命が、いま動き出す。