清く正しい学園生活を是とするお嬢様学校、私立リリアン女学園。ここには“姉妹（スール）”という、上級生と下級生が姉妹となることを誓ったうえで指導を行う、一風変わった風習があった。その高等部に通う1年生・福沢祐巳は、理想の先輩で2年生の「紅薔薇のつぼみ」こと小笠原祥子に指導を受けたことをきっかけに、全校生徒憧れのメンバーが所属する、高等部生徒会「山百合会」の本部「薔薇の館」を訪れることになる。