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舞台は彗星群が迫りつつある地球。地上に落下してくるだろう彗星の危機を回避するため、人類は“SS計画”を立案。地球衛星軌道上から迎撃するコメットブラスター部隊、その予備策として有事の際は地上から迎撃するメテオスイーパー部隊を配備し、彗星の脅威に備えた。派手なコメットブラスターが地球の防衛者と呼ばれ世間にもてはやされるなか、メテオスイーパーの少年少女たちはコメットブラスターに昇格することを目指し、日々訓練と任務に励んでいた。